Búsqueda en Medline a través
de PubMed
MEDLINE
(MEDlars onLINE) es la base de datos bibliográficos
mantenida por la National Library of Medicine (NLM)
de los Estados Unidos, que cubre los campos de
medicina, enfermería, odontología, veterinaria,
cuidado general de la salud y las ciencias preclínicas.
Medline contiene citas bibliográficas
y resúmenes de mas de 3800 revistas biomédicas de más
de 70 países. Contiene mas de 8,6 millones de artículos
que datan desde 1966 hasta la fecha.
El 75 % de los artículos se encuentran en inglés.
Es la base de datos más consultada en el ámbito de
la salud. Hasta hace poco tiempo se podía consultar
en algunas bibliotecas, ya fuera, en su formato en
papel, conocido como Index Médicus,
y últimamente en su formato digital (CD-Rom).
Actualmente y gracias a Internet se pueden realizar búsquedas
bibliográficas a través de la red de redes.Existen
diferentes sitios en Internet que nos ofrecen la
posibilidad de realizar una búsqueda bibliográfica
en la base de datos biomédica Medline, desde 1966
hasta la fecha, sin embargo la National Library of
Medicine, creadora de esta base de datos, nos ofrece
por medio del PubMed http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/ diferentes sistemas
de búsqueda de acuerdo a nuestra necesidad.
Tipos de búsqueda
PubMed nos
ofrece cinco formularios diferentes para realizar una
búsqueda:
- Básica
o Basic Search
- Avanzada
o Advanced Search
- Clinical
Queries
- Journal
Browser
- MeSH
Browser
Básica o
Basic Search: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/
Nos permite
encontrar información con el solo ingreso de las
palabras claves o frases. Se permite el ingreso de
uno o más términos siempre que se respete la
sintaxis y ortografía inglesa. Nos permite buscar
también autores (por su apellido); los nombres de
autores deben ser escritos de la siguiente manera
"Stuart RG", pero las iniciales son
opcionales. Los títulos de revistas pueden ser
escritos en forma completa, así como abreviaturas válidas
en MEDLINE o como número ISSN (ver "Journal
Browser" para mas información). Finalmente
utilice el menú desplegable para especificar en los
años que desea buscar y la cantidad de artículos
que mostrará por página.
Avanzada o
Advanced Search: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/medline.html
Esta página
nos permite realizar búsquedas definiendo campos
específicos y el uso de operadores booleanos o lógicos
(AND, OR y NOT). El ingreso del término o frase a
buscar es igual que en el formulario básico, pero en
este caso tiene el agregado que se puede seleccionar
el campo "field" sobre el que nos interesa
buscar por ejemplo, palabras que estén dentro del título
o en el cuerpo del resumen, número de pagina y el
modo "mode" de realizarlo ya sea en forma
de lista o automático.
En el modo "List Terms" cuando se ingresa
un término, PubMed nos muestra una lista de términos
disponibles, que comienza con el primer carácter
ingresado. Se puede seleccionar uno o más términos
para agregar a la búsqueda. Por ejemplo para ver los
términos que comienzan con "pneum"
selecciones "Text Terms" y "List Terms",
y luego presione Search . El modo de "List Terms"
permite recorrer él termino en cualquier campo. Esto
puede ser muy útil cuando no se sabe la gramática
de una palabra.
En el modo "Automatic", él o los términos
que Ud. ingresa son inmediatamente agregados a su búsqueda.
Si Ud. ingresa más de una palabra, PubMed buscará
la frase que contenga los términos ingresados. Si no
encuentra una frase correcta esos términos se unirán
con AND para la búsqueda en cuestión. Si la búsqueda
falla, a pesar que la gramática de los términos sea
correcta, se la puede forzar, colocando la o las
palabras entre comillas, así PubMed las agrupa como
uno desea.
Campos de
búsqueda "Search Fields"
Existen una
serie de campos en la base de datos PubMed. A
continuación se da una descripción de cada campo.
Si Ud. ingresa una secuencia de búsqueda en forma
directa sin utilizar el menú desplegable para
especificar el campo, se deberá usar la abreviatura
correspondiente entre corchetes. La abreviatura válida
para cada campo está incluida entre corchetes en las
descripciones más abajo
· Affiliation [AD, AFFL] :contiene
la afiliación institucional y la dirección del
autor principal y a veces de otros autores.
· All Fields [ALL] : abarca todos
los campos utilizados en PubMed.
· Author Name [AU, AUTH] : contiene
la lista de autores de una publicación de la
literatura. El formato para nombres de autor es el
apellido, seguido de un espacio y la o las primeras
iniciales sin puntos. Por ejemplo, Frank A.Oski sería
Oski FA; Andrew Spooner sería Spooner A. Se pueden
omitir las iniciales en la búsqueda.
· E. C. Number [RN, ECNO] :es el número
asignado por la "Enzyme Commission" para
designar una enzima en particular. Este campo incluye
los números de registro de CAS.
· Journal Title [TA, JOUR]: es el
nombre de la revista donde se publicó el artículo.
Los nombres de las revistas se almacenan en forma
abreviada, por ejemplo el Journal Of Gastroenterology
And Hepatology esta como J Gastroenterol Hepatol. Si
Ud. no está seguro como se abrevia el nombre de una
revista, use el modo "List Terms" para
encontrarlo. También puede ingresar el nombre
completo o el número ISSN en este campo. También
existe un buscador de publicaciones o "Journal
Browser" para una búsqueda exhaustiva con el
nombre completo, abreviatura y el número ISSN de una
revista.
· Language [LA, LANG] : es el
idioma en que el artículo fue publicado.
· MeSH Major Topic [MAJR] : incluye
todos los términos MeSH (ver abajo) que están
marcados como de mayor importancia por los
indexadores de MEDLINE en la National Library of
Medicine.
· MeSH Terms [MH, MESH] :incluye
todos los términos del "Medical Subject
Headings", que es el vocabulario controlado que
se utiliza para indexar en el MEDLINE. A cada cita de
MEDLINE le es asignada un grupo de términos MeSH que
se relacionan con el tema sobre el cual se basó el
artículo. Frecuentemente los términos MeSH
contienen un término adicional llamado "subheading",
que define como se relaciona el término con el artículo
que está asociado, por ejemplo "meningitis/diagnosis".
Buscando en el árbol de términos MeSH (en este
caso, pneumonia) nos mostrará todos los artículos
que utilizan ese término MeSH ya sea que contenga términos
adicionales o no. Utilice los "subheadings"
si requiere más especificidad que con el término
MeSH solo.
Nota: Los términos MeSH buscados
mediante los campos Mesh o Mesh Major son automáticamente
"expandidos" por PubMed, esto significa que
todos los subtérminos relacionados son incluídos.
Por ejemplo "hearing disorders" -trastornos
de la audición- incluye "deafness"-sordera-.
Los términos MeSH encontrados utilizando el campo
"All Fields" no son expandidos.
· Modification Date [MDAT] :
contiene la fecha en la cual la cita fue colocada en
PubMed, el formato es año/mes/día, así también
para "Publication Date", ver abajo.
· Page Number [PAGE] :es el número
de la primera hoja del artículo en la revista
publicada.
· Publication Date [DP, PDAT] :
contiene la fecha en la cual el artículo fue
publicado, el formato es año/mes/año por ejemplo
1985/12/19. Si sólo se coloca el año (ej. "1985")
nos mostrará todos los artículos publicados ese año,
año y mes (ej. "1995/03") nos mostrará
los del mes correspondiente. Note que las revistas
varían según la fecha de publicación, algunas
incluyen sólo el año, otras el año y el mes y
otras años, mes y día. PubMed toma en cuenta la
fecha que aparece en la publicación.
· Publication Type [PT, PTYP] :
refiere la forma de presentación del artículo u
otro trabajo. Ejemplos: revisiones (reviews), ensayos
clínicos (clinical trials), estudios aleatorios
controlados (randomized controlled trials).
· Substance [NM, SUBS] : contiene
los nombres de cualquier sustancia química asociada
con el registro Chemical Abstract Service (CAS) y el
campo "Name of Substance"
· Text Words [TW, WORD] : incluye
todas las palabras en el título o resumen (abstract),
además de las palabras individuales de los términos
MeSH y sustancias químicas.
· Title Words [TI, TITL] : incluye
sólo aquellas palabras encontradas en el título de
la cita.
· Volume [VI, VOL] : es el número
de volúmen de la publicación donde el artículo fue
publicado.
· Medline ID [UI, MUID] : es el
identificador único para una cita MEDLINE.
· PubMed ID [PMID] : es el
identificador único de PubMed para una cita.
La búsqueda
avanzada no solamente finaliza luego de haber
ingresado el primer término o frase, sino que nos
permite seguir limitando o expandiendo la búsqueda
mediante la utilización de los campos o "fields",
ingresando nuevos términos y combinando mediante el AND,
OR, NOT
Clinical
Queries: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/clinical.html
Este es un
buscador especializado que tiene incorporados "filtros
metodológicos" para búsquedas clínicas.
Propone cuatro categorías: terapéutica
(therapy) , diagnóstico (diagnosis)
, etiología (etiology) y pronóstico
(prognosis) más dos categorías sobres las que hace
énfasis: sensibilidad (sensitivity),
este toma artículos relevantes y no tan relevantes y
especificidad (specificity), es más
precisa pero con menor cantidad de artículos.
Este sistema se basa sobre el artículo: Developing
optimal search strategies for detecting clinically
sound studies in MEDLINE, Haynes RB, J Am Med Inform
Assoc 1994 Nov; 1 (6) : 447-458.
El formulario de ingreso de datos es similar a los
otros, y solo requiere tipear la palabra y elegir los
filtros a aplicar: por ejemplo tratamiento de migraña:
tipeo migraine y elijo "therapy" y "specificity".
Journal
Browser: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/jbrowser.html
Esta página
se utiliza para buscar las publicaciones indexadas en
Medline, por título, abreviatura del título o el
ISSN (International Standard Serial Number)
correspondiente. Es importante conocer la abreviatura
por la cual Medline indexa las publicaciones, ya que
en la búsqueda avanzada nos permite ser más
efectivos, por ejemplo necesito un artículo escrito
por John Smith en el "New England Journal of
Medicine" en el año 1990. Esto se hace más ágil
si conozco que la abreviatura de esta publicación es
"N Engl J Med".
MeSH
Browser: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/htbin-post/Entrez/meshbrowser?
Los términos
MeSH (Medical Subject Headings), componen el tesauro
o vocabulario de términos controlado de Medline, se
estima que son aproximadamente 18.000. Todos los artículos
publicados son indexados o catalogados por sus
palabras claves. Estas se deben siempre encontrar
dentro de este vocabulario. Es por eso que se
considera la mejor manera de iniciar una búsqueda
por este formulario. Cada uno de estos términos a su
vez posee subencabezamientos que permite limitar o
expandir la búsqueda, por ejemplo: si seleccionamos
migraña, podemos elegir todos las subencabezamientos
relacionados o sólo algunos como clasificación,
complicaciones o tratamiento.
Citation
Matcher: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/wgetcit.html
Nos permite encontrar diferentes citas bibliográficas
sobre la base de algunos datos como: nombre del
journal o publicación, fecha de publicación, volúmen,
número de la revista, número de página y apellido
del autor (las iniciales son opcionales). A mayor
cantidad de datos más probabilidades de encontrar la
cita.
Solo para
Expertos
Esta sección explica las características de PubMed
que pueden ser de interés para los usuarios con
necesidades específicas. La mayoría de los usuarios
no necesitan familiarizarse con los ítems de esta
sección.
Una búsqueda puede ser hecha especificando los términos,
campos y la operación lógica, todo a la vez. Se
debe usar la siguiente sintaxis:
término [campo] , operador termino [campo]. (etc.)
término
es aquel que se quiere buscar, se puede utilizar raíz
de palabras con asterisco al final. Por ejemplo
"smith*[auth]" nos muestra todos los
nombres de autor que comienzan con "smith".
campo
es la designación del campo de PubMed, a continuación
la lista de ellos AD: affiliation, ALL: all fields,
AU: author, TA: journal title, MAJR: MeSH Major
Topic, MH: MeSH terms, MDAT:modification date, PAGE:
page number, PDAT: publication date, PT: publication
type, NM: substance name, TW: text words, TI: title
words, and VI: volume.
operador
puede ser: AND ( intersección), OR (unión), NOT (diferencia).
Nota : Las
expresiones lógicas generalmente se procesan de
izquierda a derecha. Si desea que una parte de la
expresión lógica sea procesada fuera de orden, colóquela
entre paréntesis.
Ejemplo de expresión lógica: Buscar artículos en
el Journal of Pediatrics que contenga el termino
"seizure" en el texto: seizure [TW] AND J
Pediatr [TA]
Obtención
de los artículos
Una vez finalizada la búsqueda obtendrá una
cantidad de artículos de acuerdo a los términos
ingresados. La página donde se muestran se llama
"Document Summary Page". Allí nos muestra
los artículos con el nombre o título, nombre del
autor principal, nombre de la publicación y su
correspondiente cita bibliográfica. A partir de aquí
podemos seleccionar de que manera queremos ver los
artículos, los formatos de vista disponibles son:
Citation report - Cita del artículo,
título, autores, dirección o afiliación, resumen,
términos MeSH, sustancias químicas, números de
identificación única de MEDLINE y PubMed.
Abstract report - Cita del artículo,
título, autores, dirección o afiliación y resumen.
MEDLINE report - Forma tradicional
con campos de 2 caracteres para todos los campos de
MEDLINE. Este formato se utiliza para copiar las
citas en los programas de manejo bibliográfico.
Por defecto siempre lo mostrará del modo de resumen
o "abstract".
Una vez que podemos leer los artículos, PubMed nos
permite imprimir, o guardar la búsqueda en
diferentes formatos: html o texto, para PC o Mac.
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